智能集菌儀是一次性試用全封閉集菌儀過濾培養器的配套產品，供試品通過智能集菌儀的定向蠕動加壓原理，通過0.45或0.22的濾膜過濾，將供試品中的細菌裁留在濾器當中的濾膜上，通過沖洗濾膜出去抑菌成分．然后把所需要的培養基通過進樣管直接引入集菌培養器中，放置在培養箱內進行無菌培養。
    1、取出一次性培養器先檢查包裝是否完好無損，在無菌室內打開包裝。
    2、將一次性培養器逐個插放在不銹鋼排液槽上。
    3、將一次性培養器的彈性軟管裝入集菌儀的蠕動泵頭，要求定位準確，軟管走勢順暢。
    4、打開待檢供試品瓶（袋）的插針孔并做環形消毒，（若檢測安瓶樣品，先將安瓶頸部做環形消毒，然后再打開）將樣品瓶（袋）定位。
    5、拔去進樣針管護套，針頭和供試品瓶口過酒精燈火焰消毒，插入樣品瓶中，開啟集菌儀，將供試品瓶倒置，實施過濾集菌（應避免雙芯針管進氣濾膜被藥液浸濕，影響進氣；若樣品為袋裝不存在該問題）重復操作每個樣品的過濾程序。
    6、完成集菌后，若樣品具有抑菌作用或含防腐劑（按抑菌性樣品的sop進行操作）
    7、啟開已滅菌好的培養基瓶，將針頭和培養基瓶口過酒精燈火焰消毒，針頭插入培養基瓶中。
    8、摘下一次性培養器頂部空氣濾器開口的膠塞，套在一次性培養器
的底口上，用軟管夾子依次開閉軟管，開啟集菌儀，將培養基泵注入的培養器內。（先取兩個夾子夾住彈性軟管定位處的兩根管子，先加入改良馬丁培養基；再取另外一個夾子夾住另外一根管子，并拔去先前的兩個夾子，加入硫乙醇酸鹽流體培養基）。
    9、用夾子夾閉與一次性培養器連接部的軟管，留出5-6cm軟管，剪除其余部分，并將開口端插在空氣濾器的開口上。
    10、分別按照藥典規定的培養時間進行培養。
    11、觀察培養情況，若需取樣分離培養，可將軟管消毒，用無菌注射器插入軟管抽取所需量做進一步檢查。